Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC091013.1-201ENST00000499752 3734 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TOPORS-202ENST00000379858 3621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL390726.6-202ENST00000635962 1365 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CHN2-211ENST00000424025 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 GOSR2-215ENST00000638374 2683 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 IL20-203ENST00000391930 1153 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 OR5AC1-201ENST00000429239 925 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 NACAP1-202ENST00000519039 641 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC025419.1-203ENST00000540652 726 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC013652.1-206ENST00000558277 789 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.27-201ENST00000617573 258 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CEACAM22P-201ENST00000446628 3016 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TGFB2-201ENST00000366929 5053 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 POU6F1-202ENST00000389243 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TMCC1-AS1-204ENST00000605830 3496 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MS4A2-204ENST00000617306 3512 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ABCB1-211ENST00000622132 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC096720.2-201ENST00000623308 2458 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ANGEL2-202ENST00000366962 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC020895.2-201ENST00000624996 1839 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 GID8-201ENST00000266069 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 SCG5-201ENST00000300175 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 NUS1P4-201ENST00000401550 585 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL691515.2-201ENST00000414765 466 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 RPL7P13-201ENST00000415103 741 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MIR8075-201ENST00000614354 80 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TATDN2P1-201ENST00000443767 2331 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PHLDB2-207ENST00000477695 5813 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL391666.1-201ENST00000442570 2764 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 SNTG1-207ENST00000522124 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PRICKLE2-204ENST00000564377 8032 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 SERPINA9-205ENST00000448305 1520 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PEG3-201ENST00000326441 8723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 LINC01304-204ENST00000454455 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PDE7A-202ENST00000396642 2986 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TDGF1P6-201ENST00000463873 448 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ZNF343-208ENST00000617391 3300 ntTSL 4 BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 NYAP2-201ENST00000272907 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 LILRA2-201ENST00000251376 4429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 SALL1-201ENST00000251020 5146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
POLR2AP24928 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms