Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AireQ9Z0E3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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