Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tpk1Q9R0M5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tpk1Q9R0M5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms