Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms