Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Irx4Q9QY61 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Irx4Q9QY61 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms