Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tcea2Q9QVN7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms