Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CNGB3Q9NQW8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CNGB3Q9NQW8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CNGB3Q9NQW8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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