Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tuba8Q9JJZ2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms