Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Pgpep1Q9ESW8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms