Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ap1s2Q9DB50 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ap1s2Q9DB50 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms