Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TrmuQ9DAT5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrmuQ9DAT5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms