Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fip1l1Q9D824 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms