Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nol3Q9D1X0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms