Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exo5Q9CXP9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms