Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GatbQ99JT1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GatbQ99JT1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms