Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Klhl22Q99JN2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms