Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR7

Clspn, Claspin, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClspnQ80YR7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ClspnQ80YR7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ClspnQ80YR7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms