Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tmed3Q78IS1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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