Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SpopQ6ZWS8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SpopQ6ZWS8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms