Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bhlhb9Q6PB60 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bhlhb9Q6PB60 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms