Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rrp12Q6P5B0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rrp12Q6P5B0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rrp12Q6P5B0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms