Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vat1Q62465 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vat1Q62465 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms