Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nptx1Q62443 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nptx1Q62443 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms