Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rbm38Q62176 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbm38Q62176 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbm38Q62176 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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