Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trpc1Q61056 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc1Q61056 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms