Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csnk2a1Q60737 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Csnk2a1Q60737 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms