Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D9

Thoc6, THO complex subunit 6 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc6Q5U4D9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Thoc6Q5U4D9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms