Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Sft2d1Q5SSN7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms