Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Trappc1Q5NCF2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc1Q5NCF2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms