Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU00

Dcdc2, Doublecortin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2Q5DU00 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcdc2Q5DU00 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcdc2Q5DU00 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcdc2Q5DU00 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcdc2Q5DU00 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dcdc2Q5DU00 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dcdc2Q5DU00 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms