Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Klhl21Q3U410 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Klhl21Q3U410 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms