Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 IRR1YIL026C 3453 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SOM1YEL059C-A 225 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SPO22YIL073C 2928 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 DSE4YNR067C 3354 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SNQ2YDR011W 4506 nt2.7□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SNC1YAL030W 354 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 NET1YJL076W 3570 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 FRE2YKL220C 2136 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 VMR1YHL035C 4779 nt2.69□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 RGA2YDR379W 3030 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 RGR1YLR071C 3249 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 VPS16YPL045W 2397 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 PAU8YAL068C 363 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 PAU18YLL064C 363 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 PAU6YNR076W 363 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 PAU20YOL161C 363 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SLM1YIL105C 2061 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SBE22YHR103W 2559 nt2.68□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SWR1YDR334W 4545 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 ROM1YGR070W 3468 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 RPL31AYDL075W 342 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.67□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 ZRG8YER033C 3231 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 RAD34YDR314C 2079 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 DYN2YDR424C 279 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 RPL33AYPL143W 324 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 ESL1YIL151C 3357 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 IKI3YLR384C 4050 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 DYN1YKR054C 12279 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 LRG1YDL240W 3054 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 TAO3YIL129C 7131 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SLD3YGL113W 2007 nt2.66□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 MOT1YPL082C 5604 nt2.65□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 SET2YJL168C 2202 nt2.65□□□□□ -1.98
TY1A-NL1Q12391 YDL118WYDL118W 381 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 RRP6YOR001W 2202 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 FLO1YAR050W 4614 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 STE6YKL209C 3873 nt2.65□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YOR019WYOR019W 2193 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 BPT1YLL015W 4680 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 ZIP2YGL249W 2115 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 RPS30BYOR182C 192 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 GCV2YMR189W 3105 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 HOS4YIL112W 3252 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YLR278CYLR278C 4026 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 PSK1YAL017W 4071 nt2.64□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YGR067CYGR067C 2415 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 SEC7YDR170C 6030 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 ACB1YGR037C 264 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 snR45snR45 172 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 DUG2YBR281C 2637 nt2.63□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 VAS1YGR094W 3315 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YPR203WYPR203W 309 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 NAM7YMR080C 2916 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YME2YMR302C 2553 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YIL169CYIL169C 2988 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 TAF2YCR042C 4224 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 RGC1YPR115W 3252 nt2.62□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 MGM1YOR211C 2646 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 ECM29YHL030W 5607 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 YNL144CYNL144C 2223 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 SDC25YLL016W 3147 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 CAT2YML042W 2013 nt2.61□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 SAS3YBL052C 2496 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 STF2YGR008C 255 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 CRS5YOR031W 210 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 ILS1YBL076C 3219 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 VTC3YPL019C 2508 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 PRP5YBR237W 2550 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 MAD1YGL086W 2250 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 FIR1YER032W 2631 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-NL1Q12391 CHS6YJL099W 2241 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 ECM21YBL101C 3354 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 RPS22AYJL190C 393 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 COX12YLR038C 252 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 KAP104YBR017C 2757 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 RAX2YLR084C 3663 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 ZIP1YDR285W 2628 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 MMS1YPR164W 4224 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 PTP2YOR208W 2253 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 INP53YOR109W 3324 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 DGR2YKL121W 2559 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 TOM1YDR457W 9807 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 CDC53YDL132W 2448 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 PNC1YGL037C 651 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 MSB2YGR014W 3921 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-NL1Q12391 DCP2YNL118C 2913 nt2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.8 ms