Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cab39Q06138 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms