Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna1cQ01815 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cacna1cQ01815 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms