Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vgll3P85442 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vgll3P85442 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms