Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H3f3aP84244 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms