Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tpm2P58774 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tpm2P58774 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms