Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pold1P52431 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pold1P52431 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pold1P52431 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms