Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cav1P49817 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cav1P49817 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cav1P49817 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cav1P49817 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms