Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl5P47962 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rpl5P47962 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms