Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nedd4P46935 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nedd4P46935 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms