Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gjc1P28229 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjc1P28229 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms