Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ggta1P23336 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ggta1P23336 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms