Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ntf3P20181 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms