Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csn1s1P19228 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Csn1s1P19228 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms