Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf271P15620 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf271P15620 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf271P15620 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms