Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UbbP0CG49 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms