Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mtnd1P03888 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms