Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FiglaO55208 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FiglaO55208 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms