Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArxO35085 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArxO35085 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArxO35085 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArxO35085 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArxO35085 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArxO35085 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArxO35085 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArxO35085 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArxO35085 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ArxO35085 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ArxO35085 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ArxO35085 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArxO35085 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArxO35085 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArxO35085 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArxO35085 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArxO35085 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArxO35085 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArxO35085 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArxO35085 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArxO35085 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms